上海有机所化学数据库，包含多个数据库，如化合物结构数据库、核磁谱图数据库、质谱谱图数据库、红外谱图数据库、物化性质数据库等，注册后可免费使用。
比较毒物基因组学数据库（CTD）是用设在北卡罗来纳州立大学（NCSU）的国立环境卫生科学研究所（NIEHS）提供的资金开发的一个免费数据库，可查询跨物种化学基因/蛋白质相互作用和化学-疾病关系以及基因-疾病关系的精确数据。
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ChEMBL数据库是欧洲生物信息研究所（European Bioinformatics Institute，EBI）开发的一个免费在线数据库，可查询靶点或化合物的生物活性数据。
中国国内的药物注册批准数据做的不错，历史数据较全，有审评结论
